การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนจากข้อมูลไมโครอาร์เรย์ของเซลล์แมคโครฟาจ RAW 264.7 ที่ถูกกระตุ้นด้วยไลโพพอลิแซกคาไรด์

เหมือนฝัน โวหารกล้า

dc.contributor.advisor	กล่าวขวัญ ศรีสุข
dc.contributor.advisor	พิทักษ์ สูตรอนันต์
dc.contributor.author	เหมือนฝัน โวหารกล้า
dc.contributor.other	มหาวิทยาลัยบูรพา. คณะวิทยาศาสตร์
dc.date.accessioned	2023-05-12T03:45:39Z
dc.date.available	2023-05-12T03:45:39Z
dc.date.issued	2561
dc.identifier.uri	https://buuir.buu.ac.th/xmlui/handle/1234567890/7313
dc.description	วิทยานิพนธ์ (วท.ม.)--มหาวิทยาลัยบูรพา, 2561
dc.description.abstract	ดีเอ็นเอไมโครอาร์เรย์เป็นเทคนิคที่ใช้ในการศึกษาการแสดงออกของยีนจำนวนหลายหมื่นยีนในเวลาเดียวกัน ซึ่ งจะมีเพียงกลุ่มยีนจำนวนหนึ่งที่มีการแสดงออกแตกต่างกันอย่างเด่นชัดเจนภายใต้สภาวะหนึ่งขั้นตอนการคัดเลือกยีนจึงมีความสำคัญในการวิเคราะห์ข้อมูลไมโครอาร์เรย์สำหรับการค้นหากลุ่มยีนที่สำคัญในการศึกษานี้ได้ทำการวิเคราะห์ข้อมูลที่ได้จากดีเอ็นเอไมโครอาร์เรย์เพื่อคัดเลือกยีนที่ตอบสนองการอักเสบ จากการใช้ชุดข้อมูลไมโครอาร์เรย์ที่ได้จากฐานข้อมูลสาธารณะเมื่อมีการกระตุ้นเซลลล์แมคโครฟาจ RAW264.7 ด้วย LPS การคัดเลือกกลุ่มยีนจะอาศัยการบูรณาการหลากหลายวิธีการอันประกอบไปด้วย การคัดเลือกยีนด้วยวิธี Feature selection การสืบค้นยีนที่เกี่ยวข้องกับการอักเสบจากฐานข้อมูลเอกสาร การสร้างเครือข่ายการแสดงออกร่วมของยีน การวิเคราะห์แบบแผนการแสดงออกของยีน การบูรณาการร่วมกับเครือข่ายปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีน และการยืนยันผลการคัดเลือกยีนด้วยเทคนิค Real time PCR จากผลการทดลองพบว่า ยีน SOCS3 เป็นยีนที่มีบทบาทสำคัญต่อการควบคุมการตอบสนองเชิงลบในการส่งสัญญาณของไซโตไคน์ซึ่งมีส่วนช่วยในการป้องกันไม่ให้เกิดความผิดปกติของระบบภูมิคุ้มกันและการอักเสบ ดังนั้นการวิเคราะห์ข้อมูลไมโครอาร์เรย์ของการแสดงออกของยีนช่วยให้เข้าใจกลไกการตอบสนองต่อการอักเสบ และอาจจะทำให้เกิดการค้นพบยีนเป้าหมายที่เป็นสาเหตุของการอักเสบและสามารถนำไปประยุกต์ใช้ในการป้องกันและการรักษาโรคที่เกี่ยวข้องกับการอักเสบต่อไป
dc.language.iso	th
dc.publisher	คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยบูรพา
dc.rights	มหาวิทยาลัยบูรพา
dc.subject	ยีน
dc.subject	มหาวิทยาลัยบูรพา -- สาขาวิชาวิทยาศาสตร์ชีวภาพ
dc.subject	การอักเสบ
dc.title	การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนจากข้อมูลไมโครอาร์เรย์ของเซลล์แมคโครฟาจ RAW 264.7 ที่ถูกกระตุ้นด้วยไลโพพอลิแซกคาไรด์
dc.title.alternative	Gene expression nlysis of microrry dt from lps-stimulted rw264.7 mcrophge
dc.type	วิทยานิพนธ์/ Thesis
dc.description.abstractalternative	DNA microarray is a technique used to study gene expression of thousands of genes simultaneously. There are only a few responsive genes that have related functions under studied condition. The gene selection process is important to analyze microarray data for finding the truly interested condition-responsive genes. In this study, microarray analysis of gene expression datasets was performed to select genes that are important for inflammatory response which was occurred in LPS-stimulated macrophage cell RAW264.7 by using microarray data obtained from public database. The responsive genes were identified by using the integration of several methods includes feature selection, searching for list genes associated of inflammation from online database, gene co-expression network approach, clustering of gene expression profiles and protein-protein interaction networks. The results from the microarray data analysis were finally confirmed by real-time PCR. We found that SOCS3 is important critical negative role in the regulation cytokine signaling. It helps to protect activities in the immune and inflammatory system. The microarray gene expressions data analysis may be help to understand the mechanism of inflammation process and might help for discovery of candidate genes caused of inflammation. This result can be applied to prevent and treatment of inflammatory disease in the future
dc.degree.level	ปริญญาโท
dc.degree.discipline	วิทยาศาสตร์ชีวภาพ
dc.degree.name	วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต
dc.degree.grantor	มหาวิทยาลัยบูรพา