การศึกษาโปรติโอมิกส์จากใบกล้วยในกลุ่ม diploid triploid และ tetraploid

บังอร ประจันบาล

dc.contributor.author	บังอร ประจันบาล
dc.contributor.other	มหาวิทยาลัยบูรพา วิทยาเขตสระแก้ว. คณะเทคโนโลยีการเกษตร
dc.date.accessioned	2020-04-06T04:06:37Z
dc.date.available	2020-04-06T04:06:37Z
dc.date.issued	2562
dc.identifier.uri	http://dspace.lib.buu.ac.th/xmlui/handle/1234567890/3850
dc.description.abstract	กล้วยที่มีความแตกต่างของจีโนมยังไม่เคยมีการรายงานเกี่ยวกับโปรตีน การศึกษาครั้งนี้จึงเปรียบเทียบรูปแบบของโปรตีนในใบกล้วยกลุ่ม ดิพลอยด์ ทริพลอยด์ และเตทตระพลอยด์ เพื่อบ่งชี้ความแตกต่างของโปรตีนที่สะสมในกล้วยแต่ละชนิด โดยตัวอย่างโปรตีนวิเคราะห์ด้วยวิธี shotgun proteomics พบโปรตีนทั้งหมดจำนวน 42,510 ชนิดที่วิเคราะห์ด้วย MaxQuant proteomics software โดยมีโปรตีนที่พบเหมือนกันของใบกล้วยในกลุ่มพลอยด์ ทริพลอยด์ และเตทตระพลอยด์แต่มีการแสดงออกของโปรตีนที่ไม่เท่ากันที่มีค่านัยสำคัญทางสถิติ False discovery rate (FDR) น้อยกว่า 0.05 พบจำนวน 30 ชนิด นอกจากนี้กล้วยทั้ง 7 สายพันธุ์ที่มีความแตกต่างของยีนยังทำให้พบ ชนิดของโปรตีนในใบกล้วยที่จำเพาะแตกต่างกันของใบกล้วยในแต่ละสายพันธุ์ ที่มีค่านัยสาคัญทางสถิติน้อยกว่า 0.05 คือ ใบกล้วยน้าไท (AA) ใบกล้วยตานี (BB) ใบกล้วยนาก (AAA) ใบกล้วยน้ำว้า(ABB) ใบกล้วยสามเดือน (AAB) ใบกล้วยหิน (BBB) และใบกล้วยเทพรส (ABBB) พบโปรตีนที่แสดงออก จำเพาะจำนวน 6 โปรตีน 11 โปรตีน 7 โปรตีน 8 โปรตีน 14 โปรตีน 9 โปรตีน และ 8 โปรตีนตามลำดับ ซึ่งความแตกต่างของยีนอาจมีผลต่อการแสดงออกของโปรตีนและการทำหน้าที่แตกต่างกันของโปรตีนในใบกล้วยแต่ละสายพันธุ์ นอกจากนี้โปรตีนที่แสดงออกจำเพาะอาจนำไปพัฒนาเป็น molecular marker สำหรับกล้วยในแต่ละสายพันธุ์ได้	th_TH
dc.description.sponsorship	งานวิจัยนี้ได้รับทุนสนับสนุนการวิจัยจากงบประมาณเงินรายได้ (เงินอุดหนุนจากรัฐบาล) ประจำปีงบประมาณ พ.ศ. 2562	th_TH
dc.language.iso	th	th_TH
dc.publisher	คณะเทคโนโลยีการเกษตร มหาวิทยาลัยบูรพา วิทยาเขตสระแก้ว	th_TH
dc.subject	กล้วย	th_TH
dc.subject	สาขาเกษตรศาสตร์และชีววิทยา	th_TH
dc.title	การศึกษาโปรติโอมิกส์จากใบกล้วยในกลุ่ม diploid triploid และ tetraploid	th_TH
dc.title.alternative	Study of proteomics from banana leaves in diploid triploid and tetraploid	en
dc.type	Research	th_TH
dc.author.email	bungonp0@gmail.com	th_TH
dc.year	2562	th_TH
dc.description.abstractalternative	Banana with different genomes have not been reported in the protein. This study compared the protein profile of diploid banana leaves were performed for identify differentially accumulated proteins to each type. Protein samples were analyzed by shotgun proteomics. A total of 42,510 proteins were identified using MaxQuant proteomics software. Thirty proteins were significantly obtained as the same protein but showing different quantitative expressions from diploid, triploid and tetraploid banana leaves (FDR< 0.05). Moreover, seven banana genotypes revealed differential expression patterns of specific banana leaves proteins. This result significantly demonstrated 6, 11, 7, 8, 14, 9 and 8 specific proteins in leaves of Kluai Nam Thai (AA), Kluai Ta Nee (BB), Kluai Nak (AAA), Kluai Nam Wa (ABB), Kluai Sam Doen (AAB), Kluai Hin (BBB) and Kluai Teparod (ABBB), respectively (FDR< 0.05). The different gene expressions in each banana type may result in different expression and functionalities of the proteins. Moreover, the specific protein may have interest in developing molecular markers for each banana type.	en