การศึกษาลำดับนิวคลีโอไทด์ทั้งจีโนมของเชื้อ Bacillus sp. ที่มีฤทธิ์ต้านเชื้อจุลินทรีย์ก่อโรค ที่คัดแยกจากดินป่าชายเลน จังหวัดชลบุรี

อลิสา เทียมสกุล; รวิวรรณ วัฒนดิลก

dc.contributor.author	อลิสา เทียมสกุล
dc.contributor.author	รวิวรรณ วัฒนดิลก
dc.date.accessioned	2026-05-25T08:25:15Z
dc.date.available	2026-05-25T08:25:15Z
dc.date.issued	2568
dc.identifier.uri	https://buuir.buu.ac.th/xmlui/handle/1234567890/17783
dc.description.abstract	งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาลำดับนิวคลีโอไทด์ทั้งจีโนม (draft genome) ของเชื้อกลุ่ม Bacillus sp. ที่คัดแยกจากดินตะกอนป่าชายเลน จังหวัดชลบุรี และระบุยีนที่เกี่ยวข้องกับการสร้างสารออกฤทธิ์ยับยั้งเชื้อจุลินทรีย์ก่อโรค 3 ชนิด ได้แก่ Escherichia coli, Staphylococcus aureus, และ Candida albicans รวมถึงศึกษาองค์ประกอบเบื้องต้นของสารที่ออกฤทธิ์ยับยั้งเชื้อจุลินทรีย์ จากการคัดแยกเชื้อกลุ่ม Bacillus จำนวน 14 ไอโซเลท พบว่าสารสกัดหยาบของเชื้อจากไอโซเลท A1-3 มีความสามารถในการยับยั้งเชื้อก่อโรคทั้งสามชนิด เมื่อประเมินค่าความเข้มข้นต่ำสุดในการยับยั้ง (MIC) และค่าความเข้มข้นต่ำสุดในการฆ่าเชื้อ (MBC) ด้วยวิธีวิธีเจือจางในอาหารเลี้ยงเชื้อเหลวแบบไมโคร พบว่าสารสกัดจากเชื้อ A1-3 มีฤทธิ์ยับยั้งต่อ C. albicans โดยมีค่า MIC และ MBC เท่ากับ 50,000 ไมโครกรัม/มิลลิลิตร ส่วนเชื้อ E. coli และ S. aureus มีค่า MIC และ MBC มากกว่า 50,000 ไมโครกรัม/มิลลิลิตร การระบุสายพันธุ์ด้วยการวิเคราะห์ลำดับเบส 16S rRNA แสดงให้เห็นว่าเชื้อ A1-3 มีความใกล้เคียงกับ Halobacillus mangrovi 99.52% และเมื่อทำการวิเคราะห์แผนภูมิต้นไม้ มีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกับเชื้อ H. mangrovi โดยมีค่าความเชื่อมั่น (bootstrap value) 97% กับเชื้อ H. mangrovi อีกทั้งยังสอดคล้องกับการวิเคราะห์ draft genome ที่บ่งชี้ความเหมือนของสายพันธุ์ (Homologous species) ด้วยโปรแกรม Nr Annotation พบว่าเชื้อ A1-3 มีลำดับโปรตีนที่เหมือนกับ H. mangrovi 86.29% นอกจากนี้เมื่อวิเคราะห์จีโนมด้วยโปรแกรม antiSMASH พบว่าจีโนมของเชื้อ H. mangrovi มีกลุ่มยีนที่สามารถสังเคราะห์สารทุติยภูมิ กลุ่ม Terpene บริเวณ Region 1.4 โดยมีลำดับยีนและโครงสร้างที่เหมือนกับลำดับยีนของเชื้อ Halobacillus halophilus DSM 2266 ในฐานข้อมูล BGCs (MIBiG accession number: BGC0000645) ที่มีค่า % similarity เท่ากับ 100% การค้นพบกลุ่มยีนสังเคราะห์สารกลุ่ม Terpene นี้สนับสนุนผลการทดลององค์ประกอบเบื้องต้นของสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพในการยับยั้งเชื้อจุลินทรีย์ก่อโรคทั้งสามชนิดด้วยวิธี TLC-Bioautography ซึ่งตำแหน่งของสารที่แสดงฤทธิ์ยับยั้งเชื้อจุลินทรีย์เมื่อตรวจสอบด้วย anisaldehyde-sulfuric acid แสดงว่าเป็นสารกลุ่ม terpene หรือ terpenoid ข้อมูล draft genome ของเชื้อ H. mangrovi ที่เกี่ยวข้องกับการสร้างสารออกฤทธิ์ยับยั้งเชื้อก่อโรคทั้งสามชนิดนี้สามารถใช้เป็นฐานข้อมูลระดับยีน เพื่อเป็นแนวทางในการพัฒนาต่อยอดสารออกฤทธิ์จากธรรมชาติโดยใช้องค์ความรู้ด้านพันธุวิศวกรรม ซึ่งอาจเป็นทางเลือกใหม่ในการรักษาโรคที่เกิดจากเชื้อดื้อยาในปัจจุบัน	th_TH
dc.language.iso	th	th_TH
dc.publisher	มหาวิทยาลัยบูรพา. สถาบันวิทยาศาสตร์ทางทะเล	th_TH
dc.subject	บาซิลลัส.	th_TH
dc.subject	ลำดับนิวคลีโอไทด์.	th_TH
dc.subject	จีโนม.	th_TH
dc.title	การศึกษาลำดับนิวคลีโอไทด์ทั้งจีโนมของเชื้อ Bacillus sp. ที่มีฤทธิ์ต้านเชื้อจุลินทรีย์ก่อโรค ที่คัดแยกจากดินป่าชายเลน จังหวัดชลบุรี	th_TH
dc.title.alternative	Study on draft genome sequence of Bacillus sp. against pathogenic microorganisms isolated from mangrove forest soil, Chonburi Province	th_TH
dc.type	Research	th_TH
dc.author.email	alisa.th@buu.ac.th	th_TH
dc.year	2568	th_TH
dc.description.abstractalternative	This research focused on studying the draft genome of a Bacillus species isolated from mangrove sediment in Chonburi Province, Thailand. The objective was to identify genes associated with the production of antimicrobial substances that affect against three pathogenic microorganisms: Escherichia coli, Staphylococcus aureus, and Candida albicans. Additionally, the study examined the preliminary composition of compounds that inhibit these microorganisms. Out of 14 Bacillus isolates tested, the crude extract from isolate A1-3 showed inhibitory activity against all three pathogens. The Minimum Inhibitory Concentration (MIC) and Minimum Bactericidal Concentration (MBC) were evaluated using the broth micro dilution method. The results revealed that the crude extract from isolate A1-3 inhibited C. albicans with MIC and MBC values of 50,000 ?g/ml. For E. coli and S. aureus, the MIC and MBC values exceeded 50,000 ?g/ml. The analysis of the 16S rRNA gene sequence identified isolate A1-3 as being closely related to Halobacillus mangrovi, with a 99.52% sequence identity. A phylogenetic tree indicated a close relationship with H. mangrovi with 97% bootstrap support. Additionally, draft genome analysis indicated a similarity with homologous species using the Nr Annotation program, revealing that isolate A1-3 shared 86.29% protein sequence identity with H. mangrovi. Further genomic analysis using the antiSMASH program identified gene clusters in the H. mangrovi genome that are capable of synthesizing Terpene-group secondary metabolites, particularly within Region 1.4. These gene sequences and structures were found to be identical to those of Halobacillus halophilus DSM 2266 in the BGCs database (MIBiG accession number: BGC0000645), with a 100% similarity. The identification of these terpene biosynthetic gene clusters supports preliminary findings from TLC-Bioautography, which indicated the presence of active compounds that inhibit all three pathogens. The active compound spots, visualized with anisaldehyde-sulfuric acid, suggest that they belong to the terpene or terpenoid group. The draft genome data of H. mangrovi, which is related to the production of active compounds that inhibit three specific pathogens, can serve as a gene-level database. This information can guide the further development of natural active compounds using genetic engineering techniques. Such an approach may provide a new alternative for treating diseases caused by drug-resistant pathogens.	th_TH